北部醫療資源豐沛，如何提升南臺灣的醫療水準，平衡南北醫療差距是國家重要的政策方向。而就近在嘉南地區設立醫學院與醫院，更是成大人與南臺灣民眾多年的夙願。夏漢民校長上任後積極爭取籌設醫學院的機會，1981年，奉行政院核准設立醫學院，暨附設醫院，更被列為國家14項重大經建計劃。

在夏漢民校長的宏願感召下，1982年黃崑巖教授返臺，協助籌設醫學院，從一磚一瓦中築起高樓，更積極向外延攬人才，許多原本服務於北部醫學院的一流師資，受黃崑巖院長的熱忱感動而南下，成為成大醫學院堅強的後盾。1983年，獨立招收第一屆學士後醫學系新生，賴清德副總統就是第3屆入學的。1984年春，第一批醫學系新生入學，1988年附設醫院正式啟用。成大醫學院是國內第一所位於綜合大學校園內的醫學院，師資及課程安排更加多元，重視醫學院學生的人文素養，期勉以醫者之心，服務南臺灣民眾，完成國家所賦予的時代使命。

創院院長黃崑巖秉持著「不想走完不啟程（Go all the way, or don’t go at all.）」的態度，克服種種困難，一肩扛起臺灣南部醫學中心的重任。如今，不論是臨床醫療、前瞻研究或人才培育，持續精進、追求卓越。同時也發揮大學的社會責任與共好精神，秉持「生命、愛心、卓越、創新」的核心精神，整合臨床、公共衛生、跨域技術等專家，勇於承擔「急症、重症、難症、罕見疾病」之社會照護責任，在臺灣社會面臨重大事件時，及時提供奧援。例如，1998年腸病毒、2003年SARS、2015年登革熱、2016年0206地震救援乃至2020年的新冠肺炎，面對疾病與災厄，成大始終站在前線，守護民眾健康，將醫學院的「生命之樹」精神，延伸到整個社會。